Предлагаю Анализы ДНК

К сожалению, рассказать подробнее не могу. Фенотипические проявления этой мутации в процессе исследования. Отдельные (протестированные) примеры вы можете посмотреть выше.
 
Результаты анализов образцов, отправленных из Москвы 1 июня 2016 года в лабораторию Независимого общества владимирского коннозаводства (партия №19)

И снова у нас лошади с ранчо Аванпост:

1. Чинара, 2016 г.р. (серебристо-вороной скалистый Big Ben - серебристо-вороная Жасмин)
http://vk.com/photo18815760_417407891
Анализы на Extension, Agouti, Silver
Extension: E/e - базовая масть вороная, может давать рыжее потомство
Agouti: a/a - базовая масть вороная
Silver: N/Z - гетерозиготная по серебристому гену
Масть: серебристо-вороная

2. Карелия, 2016 г.р. (серебристо-вороной скалистый Big Ben - вороная карачаевская Прихоть)
http://vk.com/photo18815760_417408381
Анализы на Extension, Agouti, Silver
Extension: E/e - базовая масть вороная, может давать рыжее потомство
Agouti: a/a - базовая масть вороная
Silver: N/Z - гетерозиготная по серебристому гену
Масть: серебристо-вороная

3. Сильвер, лошадь Скалистых гор, 2016 г.р. (серебристо-вороной Big Ben - серебристо-вороная Stay With Me)
http://vk.com/photo18815760_417408780
Анализы на Extension, Agouti, Silver
Extension: E/E - базовая масть вороная, не может давать рыжее потомство
Agouti: a/a - базовая масть вороная
Silver: N/Z - гетерозиготная по серебристому гену
Масть: серебристо-вороная

4. Трёшка, 1993 г.р., шетлендский пони (рыжий 35 Ранет - вороная 159 Таня II)
http://vk.com/photo18815760_417409012
Трёшка явилась загадкой. Она похожа на темно-серую, если бы не солидный возраст - 23 года... Памятуя о недавно выявленных серых лошадях, седеющих не до конца, владелец решил уточнить ее масть по генотипу.
Анализы на Extension, Agouti, Silver, Grey
Extension: e/e - базовая масть рыжая
Agouti: A/a - может давать и вороное, и гнедое потомство
Silver: N/N - серебристый ген не обнаружен
Grey: g/g - ген раннего поседения не обнаружен
Масть: бурая, с сильной возрастной сединой
 
Генетические новости

У нас две интересные новости. Во-первых, в генетической лаборатории при Независимом обществе владимирского коннозаводства разработан тест на аллель non-dun1 - аллель гена Dun, отвечающий за псевдосаврасость. Предыдущий тест реагировал на аллель non-dun2 - отвечающий за обычные масти без каких-либо дополнений.
Были сделаны уточняющие анализы на аллель non-dun1 некоторым лошадям, ранее участвовавшим в наших тестах. Итак, результаты:

Мистика, буд., ранее подтвержденная каурая - D/nd1
Масть с уточнением: золотисто-каурая, носитель аллеля псевдосаврасости

Барий, дон., ранее не подтвержденный каурый, предположительно псевдосаврасый (см. партия №1) - nd1/nd1
Масть с уточнением: золотисто-рыжий с выраженной псевдосаврасостью, гомозиготный

Гордый, дон., ранее не подтвержденный каурый, предположительно псевдосаврасый - nd1/nd1
Масть с уточнением: рыжий с выраженной псевдосаврасостью, гомозиготный

Лаванда, бп с Камчатки, предположительно с донской примесью, ранее по тесту каурая (см. партия №15 и 17) - nd1/nd2
Масть с уточнением: светло-рыжая с псевдосаврасостью, гетерозиготная

Sonitas Jessy Lena, кватерхорс - nd1/nd2
Масть: рыжая с псевдосаврасостью, гетерозиготная

Так что теперь и в России можно заказывать более точный тест на ген Dun.


И вторая новость: лаборатория Калифорнийского университета запустила тест на аллель W20 гена KIT. Мутации этого гена отвечают за доминантную белую масть, пегость типа сабино и белые отметины на ногах и голове. Мутация W20, как показали исследования, распространена достаточно широко по самым разным породам, следовательно, достаточно древняя. Так что теперь можно делать анализы и на наследование больших отметин.
 
Последнее редактирование:
Вне партий, анализ в лаборатории Независимого общества владимирского коннозаводства от 7 августа 2016 г.

Сигнал, русский тяжеловоз
PlVjtivAQ6I.jpg


Рыжий с проседью. Анализы на Silver и Roan:
Silver: N/N - серебристый ген не обнаружен.
Roan: N/N - ген чалости не обнаружен.
Масть: рыжая с осветленным защитным волосом.
 
Годовой отчет по анализам ДНК на мастевые гены, август 2015-август 2016 гг. (партии №№ 11-19, дополнительные анализы)

Представляю уже третий отчет по анализам ДНК. Должна отметить, что благодаря Сергею Ивановичу Сорокину, директору генетической лаборатории при Независимом обществе владимирского коннозаводства, российским конникам теперь стал доступен гораздо больший перечень анализов, что особенно важно после недавнего существенного изменения курса национальной валюты. Все больше и больше анализов можно делать без калифорнийской лаборатории, ура!
Перейдем к цифрам.

За отчетный период было протестировано 29 лошадей, из них:
помесей - 11 голов,
бп - 6,
советских тяжеловозов - 3,
карачаевцев - 3,
русских тяжеловозов - 2,
андалуз - 1,
лошадь Скалистых гор - 1,
дончак - 1,
шетлендский пони - 1.

Отметим, что процент беспородных лошадей среди тестируемых снизился с 29% (1 период) и 44% (2 период) до 20%.
Общее снижение количества лошадей (с 64 за первый период до 29) в моем отчете связано с тем, что благодаря наличию лаборатории в России отправлять образцы стало существенно проще, и собственноручно я отправляю все меньше и меньше образцов. Но это временно, т.к. в скором времени я начну отправлять на анализ образцы, которые накопились у меня для моей научной работы.

Был заказан 61 анализ:
Extension - 15,
Silver - 15,
Agouti - 10,
Cream - 5,
Grey - 4,
Agouti(t) - 3,
non-dun1 - 3,
Pearl - 2,
Roan - 2,
Leopard - 1,
Dun - 1.

Распределение традиционное: больше всего анализов сделаны на гены, определяющие основу масти, и на Silver, что связано с продолжением моего серебристого проекта. В этом году добавились недавно разработанные в отечественной лаборатории анализы на Agouti(t) - аллель караковой масти, на Pearl (сейчас так свезло, что была обнаружена еще одна жемчужная лошадь), а также уточненный анализ на ген Dun, позволяющий теперь исследовать псведосаврасость.

Распределение анализов по лошадям:
трем лошадям было сделано по 5 тестов (Янтарь, Принц и андалузский жеребец),
одной - 4 теста (Трёшка),
восьми - по 3,
двум - по 2 и
пятнадцати - по 1 тесту.
Мода составляет 1 анализ на лошадь, медиана - 2 анализа на лошадь.

С помощью анализов были определены следующие масти:
серебристо-вороная - 8,
рыжая, рыжая с осветленным защитным волосом, бурая, бурая с выраженной возрастной сединой - 5,
вороная - 3,
серебристо-гнедая - 2,
псевдоизабелловая - 2(!),
рыжая с псевдосаврасостью - 2 (!),
вороная с псевдосаврасостью - 1 (!),
гнедая с псевдосаврасостью - 1 (!),
серая (на основе чалой) - 1,
гнедая с осветленной гривой - 1(!),
каурая - 1,
рыже-пегая типа сабино - 1,
чубарая - 1.

Через некоторое время напишу выводы.
 
Последнее редактирование:
Чему мы научились за прошедший год

1. В конце 2015 года наконец-то были опубликованы результаты изучения гена Dun и его влияния на масть, не имеющего аналогов у других изученных видов животных, - потому-то над ним и работали так долго. Была обнаружена мутация, определяющая псевдосаврасость - очень призрачное, плохо определенное явление, которое теперь, благодаря тесту, можно изучать прицельно. Это открытие очень важно для проекта Татьяны Зубковой: если вы помните, ранее нам очень сильно путали карты дончаки и буденновцы с ремнями, которые, согласно тесту, все-таки не были каурыми... У некоторых лошадей, ранее тестировавшихся для проекта, псевдосаврасость была подтверждена, в частности у Бария (см. партию №1).
Теперь псевдосаврасость можно отнести к мастевым явлениям.
Мы пока не знаем достоверных отличий рыжих псевдосаврасых лошадей от каурых и гнедых с псевдосаврасостью от обычных гнедых - но можем сказать, что на фоне вороной масти псевдосаврасость может дать заметный загар. Требуется дальнейшее исследование этого мастевого явления.

2. Нам попалась еще одна жемчужная лошадь (псевдоизабелловая). Теперь в России 3 лошади жемчужных мастей (или 4 достоверных носителя аллеля Pearl).

3. В моем серебристом проекте впервые попалась лошадь гнедой масти с осветленной гривой. Раньше я только читала об этом у Лесли Катман, а теперь оказывается, что и у нас они есть... Хотя, как видите, встречаются значительно реже, чем серебристо-гнедые. Фенотипическое различие этих мастей требует исследования.

4. Теперь лаборатория С.И. Сорокина делает также и анализы на Agouti(t) - аллель караковой масти, аллель Pearl гена MATP, гены Leopard и Pattern-1 (гены чубарой масти), ген Dun (саврасость и псевдосаврасость).

5. Иногда возрастное поседение может быть настолько сильным, что лошадь похожа на темно-серую в солидном возрасте - см. пони Трёшку (партия №19).

Все проекты продолжаются - мой "серебристый", "саврасый" проект Зубковой, проект Евгения Матузова по выведению пользовательной аллюрной серебристо-вороной лошади, исследования Сергея Ивановича Сорокина. В апреле этого года я стала соискателем на кафедре коневодства РГАУ МСХА им. Тимирязева и теперь работаю над диссертацией по мастям. В мае я совершила свою первую поездку по конным заводам за образцами. Так что в ближайшее время большая часть моих анализов будет делаться для моей работы. Очень многие из анализов, которые были сделаны ранее, будут также использованы для научных целей.
 
Последнее редактирование:
Вне партий, анализ в лаборатории Независимого общества владимирского коннозаводства от 20 августа 2016 г.

Белорусский упряжный Буран 67 2010 г.р. (буланый Сеньор 30 - булано-саврасая Боярыня 32)

K_kItLuLppc.jpg


dKXN1rcpzys.jpg


_fQnicq0yHU.jpg


Буран выглядит гнедо-саврасым, но вызывал вопросы его сильно осветленный защитный волос - "иней"?
Анализы на Silver и Dun:
Silver: N/Z - гетерозиготен по серебристому гену.
Dun: D/nd2 - гетерозиготен по гену саврасости.
Масть: серебристо-гнедо-саврасая.

Это первый случай подтверждения такой масти в моем проекте. Масть для визуальной идентификации очень сложная. Скорее всего, у Бурана была серебристо-булано-саврасая или серебристо-гнедо-саврасая мать - буланую масть сложнее спутать с какой-либо из серебристых мастей, чем принять серебристое осветление защитного волоса за выраженный "иней". Напомню, что ранее у нас уже были серебристо-вороная Муза и серебристо-мышастая Монетка (см. партию № 3).

Благодарю Валерию Короткевич, конного фотографа и популяризатора белорусской упряжной породы, за участие в серебристом проекте.
 
Если позволите, на правах новой хозяйки Бурана 67 покажу,как он сейчас выглядит и тоже хочу выразить огромную благодарность Валерии Короткевич, за содействие в проведении данной генетической экспертизы.
 

Вложения

  • zxR5tH9grx8.jpg
    zxR5tH9grx8.jpg
    216 KB · Просмотры: 1.039
  • N2sv3cKoDWM.jpg
    N2sv3cKoDWM.jpg
    235 KB · Просмотры: 999
Результаты анализов образцов, отправленных из Москвы 28 сентября 2016 года в лабораторию Независимого общества владимирского коннозаводства (партия №20)

1. Догма 2016 г.р. (белорусский упряжный булано-саврасый Гарпун - на 3/4 русская рысачка гнедой масти)
https://pp.vk.me/c638124/v638124760/327b/kIbjLyvkF_I.jpg
Анализы на Extension, Agouti, Cream и Dun. Результаты:
Extension - E/E - лошадь генетически вороная
Agouti - a/a - лошадь генетически вороная
Cream - Ccr/N - гетерозиготна по аллелю Cream
Dun - nd2/nd2 - саврасость не обнаружена
Масть: пепельно-вороная

2. Десерт 2016 г.р. (серебристо-вороной Талисман - серебристо-вороная Джина (Джинджер))
https://vk.com/album18815760_228798809?z=photo18815760_434080284/album18815760_228798809
Пусть вас не смущает рыжеватый окрас жеребенка. Оба его родителя протестированы, и только один из них гетерозиготен по Extension, следовательно, генотип может быть либо EE, либо Ee. И то, и другое - вороная в основе своей масть.
Анализ на Silver:
Silver - Z/Z
Масть: серебристо-вороная

Это второй в практике лаборатории Сорокина случай гомозигоности по аллелю Z и третий такой подтвержденный случай в России.

3. Willow Tree Indy 2003 г.р. (пепельно-вороной Willow Tree's Amigo - серая Heidi), уэльский пони, сектор B
http://www.kskverona.ru/index.php?id=347
Инди необычная пони. Я видела ее впервые на одном из Эквиросов. Она зарегистрирована изабелловой, но белоснежная (а как мы знаем, изабелловая масть имеет цвет ряженки), только защитный волос желтоватый. Стоявшая рядом со мной посетительница сказала своему ребенку: "Смотри, лошадка-альбинос!"
Не альбинос, конечно. Но я присмотрелась и заметила, что у нее темно-красные зрачки. Инди попала во 2-е издание моей книги "Масти лошадей" как пример предполагаемого глазного альбинизма. Наличие серой матери навело меня на мысль, что она на самом деле серая, поседевшая до светло-серого. К тому же она давала серых жеребят от несерых отцов.
Анализ на Grey:
Grey - G/N
Масть: серая (на основе изабелловой)

4. Eyarth Jordan 2006 г.р. (буланый (?) Eyarth Tacoma - серая Eyarth Ophelia), уэльский пони, сектор B
djordan__izabellovay_125668_678_b.png

Джордан (это она, а не он, если что), также зарегистрированная изабелловой, показалась мне похожей на Инди, поэтому анализ был сделан тот же.
Анализ на Grey:
Grey - G/N
Масть: серая (на основе изабелловой)

5. Жасмин
6dbecd9074a2.jpg

Это уже знакомая нам Жасмин Евгения Матузова из серебристого проекта (см. партию №6). Поскольку в сравнении с остальными его серебристо-вороными лошадьми она как-то заметно сильно выгорала, до желтого, и имела светло-карие глаза, умные люди подсказали мне поставить вопрос о серебристо-пепельно-вороной масти.
Анализ на Cream:
Cream - N/N
Масть: серебристо-вороная

6. Катунь, бп с Камчатки, ранее определенная как вороная в загаре (см. партию №). Возникло подозрение о псевдосаврасости.
Анализ на Dun:
Dun - nd2/nd2
Масть: вороная в загаре

7. Фредерика, шетлендский пони (Девясил - Фанта)
19232b.jpg

Странная пони, выгоревшая, с ремнем на спине и белым волосом в ушах. Ранее подозревалась пепельно-вороная масть, но не подтвердилась (см. партию №3).
Анализ на Dun:
Dun - nd1/nd2
Масть: вороная с псевдосаврасостью
 
Здравствуйте. Хотелось бы провести тест на ген Cream для не очень вороной кобылы. Что для этого нужно? Простите, если этот вопрос уже обсуждался, просто нужна самая актуальная информация. Спасибо. Связаться со мной можно через ВКонтакте https://vk.com/id52195560 или по электронной почте [email protected], потому что на этом сайте бываю нечасто.
6ralKmTZQJQ.jpg
 
Последнее редактирование:
Новые тесты

С некоторым запозданием сообщаю о том, что теперь в лаборатории Сергея Ивановича Сорокина можно делать анализы ДНК лошади не только на мастевые гены.

Ген MSTN
Определяет тип мускулатуры применительно к переносимости нагрузкок - аэробных и анаэробных.
Генотип T/T характерен для стайеров,
генотип C/C - для спринтеров,
генотип C/T - для средневиков.
Тест рекомендуется скаковым и пробежным лошадям, рысакам.

Ген DMRT3
Определяет склонность к нестандартным аллюрам - ходе, иноходи, тропоте, полуиноходи.
Лошади с генотипом AA и CA аллюрные,
лошади с генотипом CC - обычные.
Тест рекомендуется для заводчиков аллюрных лошадей, заводчиков рысаков, а также в случае, если у вашей лошади наблюдаются странные и плохо исправимые нарушения хода - возможно, это определено генетически, и тренинг мало что даст.

Гены CKM, PDK4 и COX412
Отвечают за скаковую, беговую и, возможно, пробежную работоспособность. Рекомендуются скаковым и пробежным лошадям, рысакам.
 
Здорово! То есть, другими словами существуют гены, отвечающие за выносливость и скорость восстановления лошади?!
 
Новые тесты

С некоторым запозданием сообщаю о том, что теперь в лаборатории Сергея Ивановича Сорокина можно делать анализы ДНК лошади не только на мастевые гены.

Ген MSTN
Определяет тип мускулатуры применительно к переносимости нагрузкок - аэробных и анаэробных.
Генотип T/T характерен для стайеров,
генотип C/C - для спринтеров,
генотип C/T - для средневиков.
Тест рекомендуется скаковым и пробежным лошадям, рысакам.

Ген DMRT3
Определяет склонность к нестандартным аллюрам - ходе, иноходи, тропоте, полуиноходи.
Лошади с генотипом AA и CA аллюрные,
лошади с генотипом CC - обычные.
Тест рекомендуется для заводчиков аллюрных лошадей, заводчиков рысаков, а также в случае, если у вашей лошади наблюдаются странные и плохо исправимые нарушения хода - возможно, это определено генетически, и тренинг мало что даст.

Гены CKM, PDK4 и COX412
Отвечают за скаковую, беговую и, возможно, пробежную работоспособность. Рекомендуются скаковым и пробежным лошадям, рысакам.
Стоимость и материалы для анализа такие же, как на масть?
 
Материалы те же, стоимость другая: первые два гена по 2000 рублей, три остальных - по 1000 рублей. Все 5 генов за 5000 рублей.
 
Уникальное предложение от отечественной генетической лаборатории

Этот вечный спорный вопрос: почему иноходит лошадь, отчего она сбивается с нормальной рыси - либо на иноходь, либо на ходу? Есть мнение, что это проблемы со спиной, и все. Однако западные ученые выяснили, что нестандартные аллюры могут иметь и генетические причины - мутацию A гена DMRT3. Анализ на этот ген уже давно запущен в западных лабораториях, но теперь есть возможность сделать его и у нас.
Теперь уникальное предложение: до 30 мая у вас есть возможность сделать вашей лошади анализ на ген DMRT3 со скидкой 50% - т.е. за 2500 рублей.
Анализ рекомендуется, если ваша лошадь демонстрирует более или менее явные нарушения аллюра, особенно если она принадлежит к рысистым или аборигенным породам, а также к кабардинской или карачаевской или имеет примесь их крови. Анализ можно также делать и лошадям других пород.

* В рамках акции до 30 мая на 50% также снижена стоимость анализов на гены MSTN (определяет разницу между спринтерами, стайерами и средневиками, актуален для скаковых и рысистых пород) и PDK4 (определяет скаковой и беговой потенциал лошади).

Дополнительная информация по адресу [email protected] или у меня в личке.
 
Сверху