Очень похоже на то, что жеребёнок переохладился. При переохлаждении могла сесть любая микрофлора, поэтому лёгкие не исключаю, а скорее склоняюсь к ним же ещё до прочтения мнения зоотехника. Какая у вас погода, не было ли дождей и сырости перед тем как заболел жеребенок? 39,5 это более высокая, чем нормальная температура. Нужны антибиотики, бициллин слабый, берите байтрил. Колоть по 1,5 кубика раз в сутки глубоко внутримышечно, подкожно остаются шишечки и долго проходят. Кормите насильно из детской бутылочки. Поноса нет?
Хорошо бы электролит подавать, он поможет сохранить энергию. Поспрашивайте в человеческой аптеке Хумана - человеческий электролит. Если температура будет повышаться, колите кальция борглюконат.
---
В сезон дождей и похолодания наблюдаю очень похожие симптомы у жеребят+оранжевый кал студенистой консистенции. Много жеребят от этого падает.
Кобылу доить, жеребёнка кормить каждые час-полтора часа по 400-500 грамм. Если у кобылы молока нет, то разбавить коровье молоко сахаром. После кормления поднимать на ножки, если сам не встаёт. Следите, чтобы в деннике было очень много подстилки, по возможности соломы. Если он вялый и будет падать, потом будут отёкшие и израненые суставы, их долго лечить.