На данный момент вам надо обследоваться. Сдать анализы крови обязательно, клинику и биохимию, на бабезиоз провериться. Нужно понимать, что вообще с лошадью происходит. Может там проблемы с иммунитетом, к примеру, поэтому организм не может справиться с инфекцией.
До применения каких-либо антибиотиков, переделать бак.посев из свища. Посмотреть, что там обнаружится, и на какие а/б отвечает.
Только шкуру вокруг свища забрить нужно и обработать, чтоб бактерии с шерсти в анализ не попали и не смазали картину. И обрабатывать будет проще.
Может иммуностимуляторы имеет смысл подключить к антибиотикам, если организму самому сложно справляться с инфекцией...
Физиотерапию можно еще попробовать. Лазерное излучение тоже обладает антибактериальным эффектом...