Приучайте по одной корове (я не спец, но может можно часть сосков в аппарат поместить, часть вручную, чтоб корове не так волнительно было и чтоб быстрее дело пошло), как одну приучите - переходите ко второй. Так потихоньку всех и приучите.
Кстати, читала когда-то зоотехника какого-то, коровы могут не любить автоматическую дойку из-за неправильных настроек аппарата.
Большую тару купить вроде тоже не проблема (чтобы лишнюю работу не делать, работая с каждой баночкой отдельно)
Электрические маслобойки не дорогие есть (8-10 тысяч рублей на объем в 10 литров). Сепараторы электрические тоже по 5-13 тысяч есть. За час до 100 литров обрабатывают (и очищают заодно от мелкого сора)
Автопоилки сделать (или хотя бы просто шланг провести, чтобы не таскать ничего). Это все деньги (не большие, но тем не менее), зато это освободит время и повысит эффективность/качество.
Оптимизировать работу, в общем. Чего именно вам не хватает для осуществления ентого дела?