Поскольку сайт не дает отправить сообщение в тему с количеством изображений более двадцати, смотрите **иллюстрации** в статье по ссылке
Варианты вируса против вакцин (Variants v. Vaccines)
Гонка между черепахой и зайцем (The Race between the Tortoise and the Hare)
2021 год обещал нас спасти. Наконец-то вакцины были здесь. Это был вопрос времени. Затем прибыл B117, взорвался в Англии, разрушил систему здравоохранения и распространился по миру.
Каждая страна сейчас находится в гонке — борьбе между новыми вариантами - английским, южноафриканским и бразильским - и массовыми вакцинациями, чтобы остановить их. Что будет в вашей стране? Спасут ли её вакцины? Или она перенесет новую волну смертей, как Великобритания?
Когда вы вернетесь к новому нормальному состоянию?
Чтобы ответить на этот вопрос, давайте разберемся, что произошло в Великобритании, соберем все, что мы знаем о B117, изучим вакцины и спрогнозируем, что произойдет в период с настоящего момента до лета.
Что случилось в Великобритании?
**Иллюстрация**
На пике
каждый день у одного из тысячи британцев диагностировался новый случай COVID . И это было не из-за лучшего тестирования.
**Иллюстрация**
Откуда это взялось?
**Иллюстрация**
Почти все новые случаи были из Англии. Они все еще развиваются там.
Этот новый штамм, теперь называемый B117, распространился из состояния почти полного отсутствия в Англии в течение нескольких недель. Посмотрите, как быстро это произошло
Тео Сандерсон @theosanderson
Как новый вариант B.1.1.7 распространился по Англии с ноября по январь. Цвет показывает долю случаев, вызванных B.1.1.7, в каждой области от 0% до 100%. 
2 февраля 2021 г.
77 ретвитов108 отметок ` ` нравится ''
Другой способ взглянуть на те же данные:
**Иллюстрация**
Этот рост произошел там
во время изоляции .
**Иллюстрация**
Источник : Оценка трансмиссивности и тяжести нового тревожного варианта SARS-CoV-2 2020, 01/12 в Англии, Центр математического моделирования инфекционных заболеваний, Лондонская школа гигиены и тропической медицины.
Как цитирует The Economist :
«Во время рождественских каникул лондонские ограничения были эквивалентны общенациональной изоляции: школы были закрыты на праздники, а большинство офисов закрыто, но число случаев заболевания по-прежнему росло».
Случаи резко упали только после еще более строгой изоляции. Это говорит нам, что мы можем превзойти новый английский вариант. Но чтобы понять, как именно и когда мы сможем это остановить, нам нужно лучше разбираться в вариантах.
B117, английский вариант
Он растет на 50-70% быстрее
Наилучшей оценкой является , что этот вариант растет в пределах от 50% до 70% быстрее , чем варианты, бывшие предыдущим мейнстримом.
Звучит не очень весомо, пока вы не поймете, что это означает на ~ 60% больше инфекций на этой неделе, и еще раз на 60% больше на следующей неделе, и снова через неделю ... Через пару месяцев у вас будет в 70 раз больше случаев.
Это может превратить видение из сна в кошмар
Если раньше странам было трудно это остановить, то сейчас им будет гораздо труднее. Если он на 60% более заразен, скорость передачи R0 в среднем увеличилась с 2,7 до ~ 4,3: без каких-либо мер и без иммунитета один инфицированный человек заражает 4,3 других. Если в стране мало случаев, потому что она применяла меры, которые снизили R с 2,7 до, скажем, 0,9, то теперь те же самые меры оставляют R только на уровне ~ 1,4 (увеличение на 60% по сравнению с 0,9). Разница между 0,9 и 1,4 такая же, как разница между днем и ночью:
**Иллюстрация**
Труднее остановиться
Снижение R с 2,7 до 1 означает уменьшение на 60%.
Снижение R с 4,3 до 1 означает уменьшение на 75%.
Эти 15 дополнительных процентных пунктов могут показаться не такими уж большими, но они есть. Страны всегда начинают с самых эффективных мер: дешевых и действенных, таких как ограничение толпы или обязательные маски. Поскольку они продолжают добавлять меры по снижению R, они становятся все более дорогими для меньшего воздействия. Таким образом, первые 15% сокращения R намного, намного дешевле, чем переход от сокращения на 60% к сокращению на 75%.
Во многих западных странах именно тогда вводят комендантский час и закрывают второстепенные предприятия (даже если
есть гораздо более дешевые меры ).
Стадный иммунитет теперь опять далеко
Мы только что повысили порог коллективного иммунитета с ~ 60% населения (через вакцины или выздоровление) до ~ 75-80%.
Если в стране 20% населения имеет иммунитет после заражения в какой-то момент, то при предыдущем варианте для достижения 60% порога коллективного иммунитета нужно было вакцинировать только дополнительно ~ 40% населения.
Теперь, с порогом в 75%, вместо дополнительных 40% населения, подлежащих вакцинации, это 55%. Это на 35% больше вакцин (55% - это на 35% больше, чем 40%) в то время, когда вакцин мало.
**Иллюстрация**
Это не только сложнее. Также требуется больше времени. Если страна может вакцинировать в среднем 5% своего населения в месяц, то для получения коллективного иммунитета с помощью предыдущего варианта потребуется 8 месяцев (то есть это будет сделано к августу 2021 года). Но с новым вариантом потребуется еще 3 месяца, вплоть до ноября.
И это предполагает, что те, кто был инфицирован в прошлом, по-прежнему имеют иммунитет. Как бразильцы узнали в Манаусе, это могло быть неправдой: они думали, что достигли коллективного иммунитета, и до 75% людей были инфицированы
1 . Затем у них была
вторая волна , вероятно, с новым бразильским вариантом, у них закончился кислород, и люди умирали, как мухи.
Это смертоноснее
Когда B117 впервые появился, большинство людей сказали: «
Нам не следует беспокоиться, обычно, когда вирусы мутируют, они становятся менее опасными. ”
Я был одним из немногих, кто предупредил, что это, к сожалению, более опасно.
Томас Пуэйо @tomaspueyo
Новый штамм #COVID более передается. Будет ли это опаснее? Многие люди не думают: «Если вирус убивает быстрее, у него меньше возможностей для распространения. Это компромисс между передачей и вирулентностью». К сожалению, это слишком упрощенно. 
29 декабря 2020
147 ретвитов360 Лайков
Было распространено мнение: «
Если вирус убивает быстрее, у него меньше возможностей для распространения. Это компромисс между передачей и вирулентностью ». К сожалению, это было слишком упрощенно.
Доказательства теории компромисса между передачей и вирулентностью не так очевидны. Эта
фантастическая статья хорошо это объясняет.
**Иллюстрация**
Дьявол кроется в деталях. Например, на ранних стадиях пандемии, когда большинство людей не инфицированы (как сейчас обстоит дело с COVID), вирулентность обычно бывает
самой высокой . В том числе и сейчас, поскольку мы очень далеки от коллективного иммунитета.
**Иллюстрация**
Вирулентность также имеет тенденцию увеличиваться, когда население сильно связано (то есть, больше контактов и перемещений - прим. Alex_Farrier), как мы с COVID, который распространяется по всему миру.
**Иллюстрация**
Так случилось во время пандемии 1918 года. Первая волна в марте-мае была менее смертоносной, чем вторая волна той зимой.
Когда вирус лучше проникает в клетки (как этот вариант), это означает, что он, вероятно, заражает гораздо больше клеток, быстрее размножается и быстрее распространяется по организму, а это означает, что его труднее остановить, а значит, он убивает больше. Таким образом, побеждают более смертоносные варианты. Об этом было известно 150 лет назад. Это называется
переходом .
**Иллюстрация**
Чтобы предсказать, станет ли этот вирус более смертоносным, нам пришлось обратиться к конкретике.
Поведение COVID сделало его прискорбным кандидатом на повышение вирулентности. Посмотрите на этот график заражения в день после первоначального заражения. Большинство инфекций происходит до появления симптомов или рано после этого.
Если вариант воспроизводится быстрее, симптомы проявляются раньше и интенсивнее, что означает более раннюю передачу. Здесь синяя и зеленая области будут иметь более высокие пики.
Кроме того, бессимптомные заболевания составляют около 50% инфекций, но не вызывают более 5% из них. Вирус, который размножается быстрее, сделает гораздо больше из них заразными. Это означает, что сегодняшняя оранжевая область станет значительно больше.
И наоборот, поскольку люди заболевают и умирают быстрее, позже они заразят меньше людей, что перерезает правую часть этого графика.
Комбинация этих двух факторов приводит к сдвигу кривой с синего на оранжевый:
В итоге, какой из них больше? Увеличение передачи на пике перевешивает снижение передачи после пика.
Больше больных означало бы больше смертей. Но смерть наступает через несколько недель после заражения, поэтому более быстрое убийство людей не снижает уровень передачи. Смерть и заразность настолько разобщены у COVID, что нет никакого давления, чтобы вирус стал менее смертоносным.
И поэтому новый вариант действительно на 30% смертоноснее.
Томас Пуэйо @tomaspueyo
Новый штамм B117, вероятно, на 30–90% более смертоносен. thesun.co.uk/news/politics/…
Гонка: вариант вируса против вакцины
Распространение по всему миру
B117 сейчас находится в
более чем 80 странах , и их количество растет. Очень сложно точно сказать, сколько его есть в каждой стране, потому что за пределами Великобритании и Дании лишь в немногих странах есть надлежащая система секвенирования геномных последовательностей. Но это все, что я мог найти.
В некоторых странах, таких как Великобритания, Израиль, Ирландия или Австрия, B117 настолько распространен, что они уже чувствуют его силу. Что касается остальных стран, когда они это почувствуют?
**Иллюстрация**
B117 почти удваивается каждую неделю. К концу февраля на него будет приходиться большинство случаев в Швеции, Франции,
Бельгии , Германии, Испании, Нидерландах, Италии, Ирландии, Люксембурге, Португалии,
Швейцарии и
Дании . В этих странах скорость передачи увеличится до 50% в течение месяца. В США это будет в
середине марта .
Так что же победит - вариант или вакцина? В одной стране победителем уже стала вакцина.
Израиль
**Иллюстрация**
Израиль ввел 60 доз вакцины на каждые 100 человек. Они увидели снижение скорости передачи примерно на
40% . Эффект начали ощущать в середине января, когда около 30% населения получили прививку.
Израиль с
мог сделать это как небольшая развитая страна с эффективной централизованной системой здравоохранения. Да, и они платили почти вдвое за вакцину. Компания Pfizer увидела выгоду в получении большего количества денег и быстрого тестирования в реальной жизни в стране, которая могла бы сделать это, и для них стало несложно отправить туда свои вакцины.
Остальные страны, к сожалению, не могут последовать так быстро.
Вакцина
Великобритания и США не так быстры, как Израиль, но они продвигаются вперед. Такими темпами за 3-4 месяца Великобритания могла бы вакцинировать большинство людей. В США, наверное, хватит до лета. В развитом мире отстают европейцы.
Чтобы понять, почему это происходит, нам нужно понять каждую вакцину. В западных странах доступно 5 вакцин, прошедших испытания III фазы. Все они в широком смысле очень эффективны.
Российская вакцина также кажется эффективной, но данные российских исследователей получены только в результате испытаний, проведенных в Москве. Учитывая послужной список России относительно политически мотивированных новостей, я не могу доверять этим данным, пока они не будут воспроизведены независимым источником. То же самое и с китайской вакциной. Судя по всему , вакцина AstraZeneca не останавливает южноафриканский вариант , но этого достаточно для английского . В общем, похоже, что с южноафриканским вариантом у нас сложнее .
Эти 5 вакцин практически устраняют все тяжелые заболевания, даже для новых вариантов. Они также устраняют большинство симптомов для традиционного варианта, и в целом они устраняют не менее 50% случаев для любого варианта. Единственный вариант, который сейчас создает больше проблем, - это вариант из Южной Африки, но против него все еще существуют хорошие вакцины.
Даже если бы новые вакцины не работали с новыми вариантами, теперь их было бы довольно легко адаптировать. Поскольку мы знаем генетический код вариантов, небольшие изменения в вакцинах, вероятно, увеличат их эффективность, сохраняя при этом те же побочные эффекты для людей. Думаю, нам не о чем беспокоиться. Нам следует беспокоиться о том, что мы не сможем провести вакцинацию достаточно быстро.
Так в чем проблема? Неужели мы не купили достаточно вакцин? Нет.
Источник
Большинство развитых стран закупили (заключили договора на поставки - прим. Alex_Farrier) гораздо больше вакцин, чем им нужно. Просто фармацевтические компании не могут производить их достаточно быстро.
Производство вакцин было еще одной историей неудач пандемии. Вакцина Moderna была создана в январе
2020 года , через
2 дня после публикации генетического кода коронавируса . Нам потребовался целый год, чтобы протестировать, утвердить, произвести и распространить. Мы могли бы сделать намного лучше.
Например, мы могли бы провести
контрольные испытания : заплатить людям, чтобы они получили вакцину, а затем заразились - вместо того, чтобы ждать, пока у некоторых инфекция произойдет естественным путем. Мы могли бы заплатить сколько угодно, чтобы люди решили, что они хотят это сделать. Если одни люди хотят этого, жертвуя ради других, зарабатывая деньги, зачем им мешать? Это потребовало бы одобрения вакцины за несколько месяцев и спасло бы сотни тысяч жизней и миллиарды в экономике.
Список ошибок при внедрении вакцины безграничен.
Зачем расширять производственные мощности *после* утверждения, а не на раннем этапе за счет государственных средств? Прямо сейчас завод Pfizer в Европе прекратил производство вакцин для расширения производства.
Зачем публично платить за вакцины вместо того, чтобы покупать их формулы, чтобы затем мы могли заставить все фармацевтические компании производить их?
Почему бы не убедить конкурентов производить вакцины-победители сразу после утверждения?
Зачем решать, кого вакцинировать и в каком порядке лишь после того, как вакцины будут одобрены, а не раньше, с учетом всех имеющихся у нас месяцев?
Евросоюз отложил утверждение своих вакцин как минимум на месяц, потому что он потратил время на обсуждение с фармацевтическими компаниями, которые несут ответственность, если вакцины не сработают. Зачем? Сэкономленные деньги бледнеют по сравнению с потраченной впустую экономикой из-за отсрочки вакцинации на один месяц.
Почему бы не посмотреть на результаты испытаний по мере их поступления, с байесовским выводом, чтобы обновить вероятность успеха в процессе? Если бы мы увидели, насколько хороши были результаты, когда они начали появляться, мы могли бы начать процесс утверждения, производство вакцины, организацию их внедрения…
Из-за всех этих ошибок сейчас у нас есть миллиарды закупленных вакцин (заключенные договора на поставки - прим. Alex_Farrier), а в наличии лишь несколько миллионов. До лета пройдет вакцинация значительной части населения развитых стран.
Черепаха и заяц
В гонке между вариантами и вакцинами варианты - это заяц, а вакцины - это черепаха.
Все мы знаем, что в конце концов вакцины победят. Как черепаха. К лету этого года в развитых странах уровень вакцинации, вероятно, составит от 50% до 80%. Поскольку также будет некоторый коллективный иммунитет, а лето означает что люди больше на открытом воздухе в Северном полушарии, то, вероятно, что пандемия спадет некоторое время в течение лета.
Вопрос в том, будут ли они развернуты вовремя, чтобы не допустить распространения новых вариантов? Теперь у нас есть ответ: к сожалению, нет.
Вариант B117, вероятно, появится в большинстве развитых стран с февраля по март. И это без учета бразильского и южноафриканского вариантов.
Развивающиеся страны находятся в еще худшем положении: у них не только будет три варианта. Им также сделают вакцины намного позже. А в Южном полушарии теперь наслаждаются летом. Зима с большим количеством вариантов и недостаточным количеством вакцин может быть менее снисходительной.
Так что держитесь еще несколько месяцев. Не теряйте бдительности. Конец туннеля близок. Сделайте вакцину, если можете. Если нет, подождите до лета. К сентябрю мы, вероятно, вернемся к новой норме в развитых странах. А в развивающихся странах будем надеяться, что больше вакцин и быстрое внедрение позволят избежать повторения 2020 года.
Оставайтесь сильными.
Томас Пуэйо
https://tomaspueyo.substack.com/p/variants-v-vaccines
Может быть, я не права, но мне это видится именно так.
