Ключи у них, конечно, есть. А вот отказ их предоставлять правоохранительным органам и создание шумихи вокруг вопроса заставляют задуматься, чьи именно интересы соблюдает Дуров и ради какой группы лиц все это делается. В законе четко определено, в каких случаях и в каком порядке организации обязаны предоставить доступ к информации, составляющей тайну переписки. Отказ - это фактически соучастие.
(Хотя теоретически можно допустить и то, что на самом деле все совсем наоборот)) Но эту версию озвучивать не буду, пожалуй))